Detalle del congreso

Autores: Pistilli, A.D.; Pratta, G.R.; Angelone, L.; Arce, D.P.

Resumen: Se presenta el desarrollo de una arquitectura en pipeline que automatiza la descarga de promotores de Solanum lycopersicum desde la Sol Genomics Network y luego los analiza con los programas MEME y TOMTOM. El código está disponible en www.github.com/lalebot/pip-prom-tom y utiliza Git como software de control de versiones. Se combina el uso de threads en Python, expresiones regulares y base de datos SQLite para que conjuntamente disminuyan el tiempo de descarga de los promotores y optimicen la utilizaci´on de recursos inform´aticos. La metodología que presenta este trabajo es potencialmente aplicable a otras áreas biológicas.

Tipo de reunión: Congreso.

Tipo de trabajo: Artículo Completo.

Producción: Diseño de una arquitectura en pipeline para la descarga y dnálisis de decuencias de promotores en Solanum lycopersicum.

Reunión científica: SABI 2017, XXI Congreso Argentino de Bioingeniería y X Jornadas de Ingeniería Clínica.

Lugar: Córdoba.

Institución organizadora: Sociedad Argentina de Bioingeniería.

Publicado: Sí

Lugar publicación: Córdoba

Mes de reunión: 10

Año: 2017.