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Authors: P. Fernandez; L. Angelone; P. Bulacio; C. Reynares; E. Tapia; N. Paniego.

Resumen: El análisis de ESTs (Expressed Sequence Tags) es una tarea fundamental en estudios de genomica funcional. Su objetivo es la identificación eficiente de genes candidatos en procesos biológicos de interés. Sin embargo, la complejidad y abundancia de los datos que caracteriza a la mayoría de proyectos de secuenciamiento de ESTs puede dificultar enormemente el alcance de los objetivos pretendidos. En este trabajo se presenta la base de datos SfGD (Sunflower Genomic Database), la cual permitirá almacenar, gestionar y consultar información genómica del girasol cultivado. Esta BD está encuadrada en un proyecto del Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria cito en Castelar, Bs. As., Argentina. Actualmente la base está siendo cargada con los datos surgidos en dicho proyecto. SfGD ha sido diseñada con el objetivo de facilitar el almacenamiento de ESTs de girasol, la comparación con ESTs de otras especies más estudiadas y la recuperación de subclases funcionales basadas en ontologías genéticas. Las anotaciones disponibles en SfGD respetan las notaciones estándares de tipificación recomendadas por GO. SfGD se presenta como un sistema abierto de gestión de datos (Apache + PHP + MySQL en Linux), que permite al usuario la carga, organización, y visualización grafica de los datos generados en el proyecto EST de girasol mediante una interface web. Esta herramienta será un recurso de acceso público para la comunidad científica interesada en consultar información molecular asociada a esta especie de interés agronómico. .

Meeting type: Congreso.

Type of job: Artículo Completo.

Production: SfGD: Base de Datos Genómicos de Girasol.

Scientific meeting: 38 JAIIO. Congreso Argentino de AgroInformática 2009.

Meeting place: Mar del Plata.

Organizing Institution: SADIO.

It's published?: Yes

Publication place: Mar del Plata

Meeting month: 8

Year: 2009.