Detalle del congreso
Autores: Pistilli, A.D.; Pratta, G.R.; Angelone, L.; Arce, D.P.
Resumen: Se presenta el desarrollo de una arquitectura en pipeline que automatiza la descarga de promotores de Solanum lycopersicum desde la Sol Genomics Network y luego los analiza con los programas MEME y TOMTOM. El código está disponible en www.github.com/lalebot/pip-prom-tom y utiliza Git como software de control de versiones. Se combina el uso de threads en Python, expresiones regulares y base de datos SQLite para que conjuntamente disminuyan el tiempo de descarga de los promotores y optimicen la utilizaci´on de recursos inform´aticos. La metodología que presenta este trabajo es potencialmente aplicable a otras áreas biológicas.
Tipo de reunión: Congreso.
Tipo de trabajo: Artículo Completo.
Producción: Diseño de una arquitectura en pipeline para la descarga y dnálisis de decuencias de promotores en Solanum lycopersicum.
Reunión científica: SABI 2017, XXI Congreso Argentino de Bioingeniería y X Jornadas de Ingeniería Clínica.
Lugar: Córdoba.
Institución organizadora: Sociedad Argentina de Bioingeniería.
Publicado: Sí
Lugar publicación: Córdoba
Mes de reunión: 10
Año: 2017.